病理科建筑总面积约800m,实验室占地500m²,设有诊断室、常规技术室、冰冻切片室、细胞室、免疫组化室、分子病理室、尸检室等，配备多人共览显微镜、全自动数字切片扫描仪、全自动脱水机、全自动染色封片机、全自动免疫组化机、液基薄层细胞制片机等先进设备。现已开展组织病理检查、细胞病理检查、术中快速冰冻切片病理检查、病理会诊、免疫组化染色、特殊染色，ISH检测、FSH检测、PCR检测等项目。
科室设置骨与软组织、淋巴造血、脑神经、消化系统、细胞病理及分子病理诊断亚组，形成了大体一形态学一免疫表型一分子造传学四位一体的综合诊断模式，进一步满足临床多学科诊断及治疗需要。现有医、技人员12人，其中高级职称6人，研究生学历8人。学科带头人为国内著名儿科病理学家殷敏智主任(上海儿童医学中心)及许淑霞主任。
